Séquençage et barcoding
Fongilab propose une solution de séquençage dédiée aux collections de champignons et d’insectes, destinée aux mycologues et entomologistes souhaitant clarifier la phylogénie moléculaire de leurs échantillons.
Nous mettons en œuvre deux technologies complémentaires :
le séquençage Sanger et le séquençage haut débit (NGS),
entièrement réalisés en interne, sans aucune externalisation,
afin de garantir une traçabilité complète et une qualité optimale tout au long de la chaîne analytique.
Séquençage Sanger ou haut débit
Le séquençage Sanger comme le séquençage haut débit permettent de déterminer la suite de nucléotides d’une région ciblée du génome.
Pour les champignons, les marqueurs les plus utilisés en taxonomie moléculaire sont les régions ITS et LSU.
L’obtention d’une séquence de 400 à 800 bases permet ensuite de la comparer aux bases de données internationales, afin d’en déterminer la correspondance la plus proche, voire de détecter des espèces encore non décrites.
Nous proposons une prise en charge complète du processus, depuis l’extraction et la purification de l’ADN jusqu’au séquençage (Sanger ou haut débit), la remise des séquences, et, selon la demande, la recherche comparative ou la construction d’arbres phylogénétiques.
Ce service est accessible à partir de 8 échantillons minimum.
Le tarif dépend de la solution choisie, et un devis personnalisé peut être établi rapidement selon vos besoins et vos projets.
N’hésitez pas à nous contacter pour obtenir plus d’informations ou discuter d’une collaboration.
