Analyse ADN des champignons du bâtiment : quelle méthode choisir pour un laboratoire champignon?

Chez Fongilab, notre laboratoire champignon spécialisé dans l’identification des champignons du bâtiment, nous utilisons l’ADN comme outil d’investigation scientifique. Mais parler « d’analyse ADN » sans précision ne veut pas dire grand-chose : il existe une multitude de techniques — PCR, qPCR, dPCR, séquençage Sanger, NGS, métagénomique… chacune ayant ses avantages et ses limites.

En mycologie du bâtiment, les échantillons sont rarement propres et homogènes. Ce sont des matrices complexes, parfois très polluées, où il faut distinguer l’ADN principal d’éventuelles spores contaminantes. C’est pourquoi nous avons choisi la qPCR comme méthode de référence.

La qPCR est l’évolution directe de la PCR, reconnue depuis plus de 40 ans comme le « gold standard » en détection moléculaire. Elle ne se contente pas de détecter un ADN : elle le quantifie, permettant de faire la différence entre un signal significatif et une trace infime sans impact réel.

Après près de deux ans de développement, nous avons mis au point une méthode unique, rapide et extrêmement fiable, adaptée aux conditions réelles du terrain. Une technologie qui fait aujourd’hui la force de notre laboratoire mérule et qui permet des diagnostics précis, même sur les échantillons les plus complexes.

Et le séquençage dans tout ça ? Il fait aussi partie de nos outils… mais c’est une autre histoire que nous vous raconterons bientôt. 😉